# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 26 16 6 4 30:16 14 54
2 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 26 11 7 8 26:20 6 40
3 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 26 9 12 5 18:17 1 39
4 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 26 8 11 7 20:16 4 35
5 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 26 10 5 10 29:30 -1 35
6 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 26 9 7 10 22:18 4 34
7 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 26 9 7 10 20:22 -2 34
8 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 26 5 10 10 15:20 -5 25
9 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 26 6 7 12 14:19 -5 25
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 26 4 10 11 11:27 -16 22
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.