# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 4 2 1 1 5:1 4 7
2 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 4 2 1 1 6:3 3 7
3 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 4 2 1 1 5:3 2 7
  FC Lugano, Schweiz FC Lugano 4 2 1 1 5:3 2 7
5 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 4 2 1 1 4:3 1 7
6 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 4 0 4 0 1:1 0 4
  FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 4 1 1 1 1:1 0 4
8 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 4 1 1 2 3:5 -2 4
9 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 4 1 1 2 1:6 -5 4
10 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 4 0 0 3 1:6 -5 0
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.