| 10. Spieltag | 16.09.2023 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | Bayern München II | 1:4 | ||||
| 11. Spieltag | 22.09.2023 | Bayern München II | - | FV Illertissen | 3:2 | ||||
| 12. Spieltag | 30.09.2023 | TSV Aubstadt | - | Bayern München II | 0:0 | ||||
| 13. Spieltag | 03.10.2023 | Bayern München II | - | SpVgg Ansbach | 4:2 | ||||
| 18. Spieltag | 27.10.2023 | Bayern München II | - | Wacker Burghausen | 4:1 | ||||
| 9. Spieltag | 31.10.2023 | FC Augsburg II | - | Bayern München II | 4:0 | ||||
| 19. Spieltag | 05.11.2023 | Türkgücü München | - | Bayern München II | 2:0 | ||||
| 22. Spieltag | 26.11.2023 | Bayern München II | - | SpVgg Bayreuth | 4:0 | ||||
| 16. Spieltag | 19.02.2024 | Bayern München II | - | SpVgg Greuther Fürth II | 0:1 | ||||
| 25. Spieltag | 16.03.2024 | FC Memmingen | - | Bayern München II | 0:4 | ||||
| 21. Spieltag | 02.04.2024 | 1. FC Nürnberg II | - | Bayern München II | 2:0 | ||||
| 29. Spieltag | 12.04.2024 | Bayern München II | - | TSV Aubstadt | 1:1 | ||||
| 34. Spieltag | 18.05.2024 | Eintracht Bamberg | - | Bayern München II | 2:1 |
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