# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 5 4 0 1 10:6 4 12
2 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 5 3 0 2 10:10 0 9
3 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 6 2 2 2 5:5 0 8
4 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 5 2 1 2 10:7 3 7
5 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 5 1 3 1 2:4 -2 6
6 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 5 2 0 3 5:10 -5 6
7 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 5 1 0 4 5:12 -7 3
8 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 5 0 3 2 4:11 -7 3
9 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 5 0 2 3 2:6 -4 2
10 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 4 0 1 3 4:10 -6 1
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.