# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 11 7 3 1 24:13 11 24
2 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 11 6 0 5 20:20 0 18
3 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 11 5 2 4 19:13 6 17
4 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 11 4 4 3 21:16 5 16
5 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 11 4 2 5 17:16 1 14
6 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 11 3 5 3 8:10 -2 14
7 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 11 3 4 4 18:21 -3 13
8 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 11 3 3 5 7:13 -6 12
9 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 11 5 2 4 16:14 2 10
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 11 1 3 7 6:20 -14 6
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.