# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 11 7 2 2 15:8 7 23
2 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 11 6 2 3 14:8 6 20
3 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 11 5 2 4 9:6 3 17
4 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 11 2 8 1 5:6 -1 14
5 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 11 4 2 4 14:12 2 14
6 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 11 3 4 4 12:12 0 13
7 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 11 3 4 4 10:10 0 13
8 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 11 3 3 5 9:12 -3 12
9 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 11 1 6 4 3:12 -9 9
10 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 11 1 5 4 2:7 -5 8
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.