# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 18 7 10 1 11:5 6 31
2 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 18 8 6 4 15:8 7 30
3 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 18 8 6 4 17:14 3 30
4 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 18 7 7 4 14:11 3 28
5 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 18 6 8 4 10:6 4 26
6 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 18 5 5 7 13:11 2 20
7 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 18 4 7 6 7:11 -4 19
8 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 18 3 10 5 6:11 -5 19
9 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 18 4 6 8 11:17 -6 18
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 18 2 5 11 3:13 -10 11
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.