# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 18 11 4 3 23:14 9 37
2 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 18 9 3 6 21:15 6 30
3 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 18 8 4 5 24:17 7 28
4 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 18 7 5 6 15:8 7 26
5 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 18 6 7 5 13:14 -1 25
6 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 18 4 11 3 11:12 -1 23
7 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 18 5 6 7 14:17 -3 21
8 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 18 4 7 7 13:16 -3 19
9 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 18 2 8 8 6:19 -13 14
10 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 18 2 7 8 7:15 -8 13
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.