# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 15 10 3 2 19:9 10 33
2 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 15 9 2 4 26:18 8 29
3 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 15 8 2 5 29:35 -6 26
4 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 14 6 2 6 24:21 3 20
5 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 14 6 0 8 18:24 -6 18
6 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 14 4 5 5 13:18 -5 17
7 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 15 4 2 9 15:24 -9 14
8 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 15 2 5 8 15:24 -9 11
9 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 14 1 6 7 11:23 -12 9
10 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 14 1 5 8 10:27 -17 8
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.