# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 AC Bellinzona, Schweiz AC Bellinzona 29 14 14 1 22:5 17 56
2 FC Aarau, Schweiz FC Aarau 29 13 11 5 24:16 8 50
3 FC Winterthur, Schweiz FC Winterthur 29 13 11 5 25:18 7 50
4 FC Lugano, Schweiz FC Lugano 29 13 9 6 24:14 10 48
5 FC Vaduz, Liechtenstein FC Vaduz 29 7 14 8 16:16 0 35
6 FC Wil 1900, Schweiz FC Wil 1900 29 7 10 11 19:19 0 31
7 FC Chiasso, Schweiz FC Chiasso 29 5 14 10 12:19 -7 29
8 FC Wohlen, Schweiz FC Wohlen 29 5 14 9 11:18 -7 29
9 FC Biel/Bienne, Schweiz FC Biel/Bienne 29 5 10 14 13:26 -13 25
10 FC Locarno, Schweiz FC Locarno 29 3 9 16 6:21 -15 18
  Aufstieg
  Abstieg

# Beim Spiel der 2. Runde FC Wil 1900 - FC Wohlen 0:1 (0:1) am 22.07.2012 stand bei Wil der nicht einsatzberechtigte Lars Leuzinger im Kader. Die Partie wurde deshalb von der Disziplinarkommission der SFL mit 0:3 gewertet.

# Beim Spiel der 19. Runde FC Locarno - FC Lugano 0:3 (0:2) am 13.02.2013 hatte Lugano acht statt der maximal erlaubten sieben nicht lokal ausgebildeten Spieler im Kader. Die Partie wurde deshalb von der SFL mit 3:0 für Locarno gewertet.

# Dem AC Bellinzona wurde wegen Verstösse gegen das Lizenzreglement sieben Punkte abgezogen.

# Der AC Bellinzona erhielt vom Schweizer Fußballverband für die Saison 2013/2014 keine Lizenz. Der FC Locarno spielt somit trotz sportlichen Abstiegs auch in der Saison 2013/2014 in der Challenge League.