| 4. Spieltag | 13.09.2008 | Werder Bremen | - | Energie Cottbus | 3:0 | ||||
| 5. Spieltag | 20.09.2008 | Bayern München | - | Werder Bremen | 2:5 |  |
|||
| 6. Spieltag | 27.09.2008 | Werder Bremen | - | 1899 Hoffenheim | 5:4 | ||||
| 9. Spieltag | 25.10.2008 | Hannover 96 | - | Werder Bremen | 1:1 | ||||
| 10. Spieltag | 28.10.2008 | Werder Bremen | - | Bayer Leverkusen | 0:2 | ||||
| 11. Spieltag | 01.11.2008 | Werder Bremen | - | Hertha BSC | 5:1 | ||||
| 13. Spieltag | 16.11.2008 | Werder Bremen | - | 1. FC Köln | 3:1 | ||||
| 15. Spieltag | 29.11.2008 | Werder Bremen | - | Eintracht Frankfurt | 5:0 | ||||
| 17. Spieltag | 13.12.2008 | Werder Bremen | - | VfL Wolfsburg | 2:1 | ||||
| 18. Spieltag | 01.02.2009 | Werder Bremen | - | Arminia Bielefeld | 1:2 | ||||
| 24. Spieltag | 15.03.2009 | Werder Bremen | - | VfB Stuttgart | 4:0 | ||||
| 30. Spieltag | 03.05.2009 | 1. FC Köln | - | Werder Bremen | 1:0 | ||||
| 32. Spieltag | 13.05.2009 | Eintracht Frankfurt | - | Werder Bremen | 0:5 | ||||
| 33. Spieltag | 16.05.2009 | Werder Bremen | - | Karlsruher SC | 1:3 |
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