| 19. Spieltag | 12.02.2000 | SV Babelsberg 03 | - | VFC Plauen | 2:1 |  |
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| 29. Spieltag | 24.04.2000 | SV Babelsberg 03 | - | Stahl Eisenhüttenstadt | 3:2 | ||||
| 30. Spieltag | 29.04.2000 | VfL Halle 96 | - | SV Babelsberg 03 | 0:1 | ||||
| 31. Spieltag | 05.05.2000 | SV Babelsberg 03 | - | BFC Dynamo | 0:2 |
Niger