| 5. Spieltag | 11.08.2023 | FC Ingolstadt 04 II | - | Jahn Regensburg II | 1:3 | ||||
| 6. Spieltag | 15.08.2023 | FC Ingolstadt 04 II | - | Würzburger FV | 3:2 | ||||
| 7. Spieltag | 19.08.2023 | SpVgg Hankofen-Hailing | - | FC Ingolstadt 04 II | 2:4 | ||||
| 9. Spieltag | 01.09.2023 | SC Eltersdorf | - | FC Ingolstadt 04 II | 2:1 | ||||
| 11. Spieltag | 08.09.2023 | FC Ingolstadt 04 II | - | 1. SC Feucht | 4:2 |  |
|||
| 13. Spieltag | 23.09.2023 | SpVgg Bayern Hof | - | FC Ingolstadt 04 II | 2:2 | ||||
| 16. Spieltag | 07.10.2023 | TSV Abtswind | - | FC Ingolstadt 04 II | 1:1 | ||||
| 25. Spieltag | 24.02.2024 | FC Ingolstadt 04 II | - | SpVgg Hankofen-Hailing | 3:1 | ||||
| 26. Spieltag | 02.03.2024 | Würzburger FV | - | FC Ingolstadt 04 II | 0:1 | ||||
| 32. Spieltag | 13.04.2024 | FC Ingolstadt 04 II | - | SpVgg Bayern Hof | 3:3 |
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