| 13. Spieltag | 20.11.1988 | BSG Lokomotive Stendal | - | BFC Dynamo II | 0:2 | ||||
| 14. Spieltag | 26.11.1988 | BFC Dynamo II | - | BSG KKW Greifswald | 4:3 |  |
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| 18. Spieltag | 25.02.1989 | Dynamo Fürstenwalde | - | BFC Dynamo II | 0:1 | ||||
| 19. Spieltag | 05.03.1989 | BFC Dynamo II | - | Motor Ludwigsfelde | 4:0 | |
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| 20. Spieltag | 12.03.1989 | Stahl Eisenhüttenstadt | - | BFC Dynamo II | 1:1 | |
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| 21. Spieltag | 19.03.1989 | BFC Dynamo II | - | BSG Aktivist Brieske-Senftenberg | 3:0 | |
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| 22. Spieltag | 24.03.1989 | Motor Schönebeck | - | BFC Dynamo II | 0:0 | ||||
| 23. Spieltag | 02.04.1989 | BFC Dynamo II | - | ASG Vorwärts Stralsund | 1:0 | ||||
| 25. Spieltag | 16.04.1989 | BFC Dynamo II | - | BSG Schiffahrt/Hafen Rostock | 3:0 | ||||
| 26. Spieltag | 22.04.1989 | FC Vorwärts Frankfurt/Oder | - | BFC Dynamo II | 1:2 | ||||
| 27. Spieltag | 30.04.1989 | BFC Dynamo II | - | BSG Motor Babelsberg | 1:0 | ||||
| 28. Spieltag | 03.05.1989 | KWO Berlin | - | BFC Dynamo II | 2:0 | ||||
| 29. Spieltag | 09.05.1989 | BSG Aktivist Schwarze Pumpe Hoyerswerda | - | BFC Dynamo II | 3:3 |
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