| 1. Spieltag | 07.08.2016 | FC Einheit Rudolstadt | - | VfL Halle 96 | 3:0 | ||||
| 2. Spieltag | 13.08.2016 | VfL Halle 96 | - | Askania Bernburg | 0:3 | ||||
| 3. Spieltag | 26.08.2016 | BSG Chemie Leipzig | - | VfL Halle 96 | 2:0 |  |
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| 4. Spieltag | 09.09.2016 | VfL Halle 96 | - | SV Merseburg 99 | 0:1 | ||||
| 5. Spieltag | 18.09.2016 | VFC Plauen | - | VfL Halle 96 | 4:2 | ||||
| 6. Spieltag | 25.09.2016 | VfL Halle 96 | - | Germania Halberstadt | 0:2 | ||||
| 8. Spieltag | 15.10.2016 | VfL Halle 96 | - | SSV Markranstädt | 5:2 |  |
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| 9. Spieltag | 22.10.2016 | Bischofswerdaer FV | - | VfL Halle 96 | 4:0 | ||||
| 10. Spieltag | 29.10.2016 | VfL Halle 96 | - | Brandenburger SC Süd | 1:4 | |
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| 11. Spieltag | 06.11.2016 | VfL Halle 96 | - | Inter Leipzig | 1:1 | ||||
| 12. Spieltag | 19.11.2016 | FSV Barleben | - | VfL Halle 96 | 3:2 | |
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| 17. Spieltag | 24.02.2017 | Askania Bernburg | - | VfL Halle 96 | 1:0 | ||||
| 19. Spieltag | 12.03.2017 | SV Merseburg 99 | - | VfL Halle 96 | 1:0 | ||||
| 21. Spieltag | 31.03.2017 | Germania Halberstadt | - | VfL Halle 96 | 5:0 | |
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