| 7. Spieltag | 13.09.2009 | FC St. Pauli II | - | VfL Wolfsburg II | 1:0 |  |
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| 10. Spieltag | 04.10.2009 | ZFC Meuselwitz | - | FC St. Pauli II | 0:0 | |
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| 11. Spieltag | 16.10.2009 | FC St. Pauli II | - | 1. FC Magdeburg | 0:3 | ||||
| 13. Spieltag | 31.10.2009 | FC St. Pauli II | - | Türkiyemspor Berlin | 2:2 | ||||
| 16. Spieltag | 27.11.2009 | SV Wilhelmshaven | - | FC St. Pauli II | 2:1 | ||||
| 30. Spieltag | 25.04.2010 | Türkiyemspor Berlin | - | FC St. Pauli II | 3:3 | ||||
| 31. Spieltag | 02.05.2010 | FC St. Pauli II | - | Hansa Rostock II | 1:2 | ||||
| 32. Spieltag | 09.05.2010 | VFC Plauen | - | FC St. Pauli II | 6:0 | ||||
| 33. Spieltag | 22.05.2010 | FC St. Pauli II | - | SV Wilhelmshaven | 0:3 | ||||
| 34. Spieltag | 29.05.2010 | SV Babelsberg 03 | - | FC St. Pauli II | 4:1 |  |
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Deutschland