| 19. Spieltag | 12.02.2017 | SC Paderborn 07 II | - | TuS Ennepetal | 2:1 | ||||
| 20. Spieltag | 19.02.2017 | FC Brünninghausen | - | SC Paderborn 07 II | 2:0 |  |
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| 21. Spieltag | 05.03.2017 | SC Paderborn 07 II | - | 1. FC Kaan-Marienborn | 3:3 | ||||
| 22. Spieltag | 12.03.2017 | SC Paderborn 07 II | - | ASC 09 Dortmund | 0:1 | |
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| 23. Spieltag | 19.03.2017 | SuS Stadtlohn | - | SC Paderborn 07 II | 2:0 | ||||
| 24. Spieltag | 26.03.2017 | SC Paderborn 07 II | - | TuS Erndtebrück | 1:0 | ||||
| 25. Spieltag | 02.04.2017 | Roland Beckum | - | SC Paderborn 07 II | 2:3 |  |
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| 26. Spieltag | 09.04.2017 | SC Paderborn 07 II | - | Hammer SpVg | 1:2 | |
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| 27. Spieltag | 13.04.2017 | FCE Rheine | - | SC Paderborn 07 II | 2:1 | ||||
| 28. Spieltag | 17.04.2017 | SC Paderborn 07 II | - | TSV Marl-Hüls | 6:0 | ||||
| 29. Spieltag | 23.04.2017 | SC Hassel | - | SC Paderborn 07 II | 4:1 | |
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| 30. Spieltag | 30.04.2017 | SC Paderborn 07 II | - | SpVgg Erkenschwick | 3:0 | |
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| 31. Spieltag | 05.05.2017 | FC Gütersloh 2000 | - | SC Paderborn 07 II | 3:1 | |
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| 32. Spieltag | 14.05.2017 | SC Paderborn 07 II | - | Arminia Bielefeld II | 2:1 | |
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| 34. Spieltag | 28.05.2017 | SC Paderborn 07 II | - | Westfalia Rhynern | 3:0 |
Deutschland