| 15. Spieltag | 10.12.2016 | VfL Halle 96 | - | FC Carl Zeiss Jena II | 1:2 |  |
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| 17. Spieltag | 25.02.2017 | FC Carl Zeiss Jena II | - | FSV Barleben | 7:0 | ||||
| 19. Spieltag | 11.03.2017 | FC Carl Zeiss Jena II | - | Union Sandersdorf | 2:3 | ||||
| 18. Spieltag | 26.03.2017 | BSG Wismut Gera | - | FC Carl Zeiss Jena II | 2:1 | ||||
| 26. Spieltag | 06.05.2017 | FC Carl Zeiss Jena II | - | Germania Halberstadt | 0:4 | |
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| 30. Spieltag | 03.06.2017 | FC Carl Zeiss Jena II | - | VfL Halle 96 | 2:3 |
Deutschland