| 1. Spieltag | 29.07.2016 | ZFC Meuselwitz | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:2 | ||||
| 2. Spieltag | 07.08.2016 | FC Carl Zeiss Jena | - | VfB Auerbach | 2:0 | ||||
| 3. Spieltag | 10.08.2016 | FSV Budissa Bautzen | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:1 | ||||
| 4. Spieltag | 14.08.2016 | FC Carl Zeiss Jena | - | SV Babelsberg 03 | 3:0 |  |
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| 5. Spieltag | 27.08.2016 | FC Carl Zeiss Jena | - | Union Fürstenwalde | 4:0 |  |
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| 6. Spieltag | 11.09.2016 | TSG Neustrelitz | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:4 | |
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| 7. Spieltag | 18.09.2016 | FC Carl Zeiss Jena | - | Berliner AK 07 | 3:0 | |
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| 8. Spieltag | 23.09.2016 | Hertha BSC II | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:3 | ||||
| 9. Spieltag | 29.09.2016 | FC Carl Zeiss Jena | - | Energie Cottbus | 0:0 | ||||
| 10. Spieltag | 15.10.2016 | FSV 63 Luckenwalde | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:1 | ||||
| 11. Spieltag | 23.10.2016 | FC Carl Zeiss Jena | - | Wacker Nordhausen | 0:0 | ||||
| 12. Spieltag | 30.10.2016 | FC Oberlausitz | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:1 |
Deutschland