| 19. Spieltag | 02.03.2013 | Eintracht Frankfurt [B-Junioren] | - | SC Freiburg [B-Junioren] | 1:0 | ||||
| 9. Spieltag | 24.03.2013 | TSV 1860 München [B-Junioren] | - | SC Freiburg [B-Junioren] | 3:1 | ||||
| 21. Spieltag | 07.04.2013 | Jahn Regensburg [B-Junioren] | - | SC Freiburg [B-Junioren] | 0:4 | ||||
| 15. Spieltag | 13.04.2013 | 1899 Hoffenheim [B-Junioren] | - | SC Freiburg [B-Junioren] | 2:1 | ||||
| 23. Spieltag | 21.04.2013 | Karlsruher SC [B-Junioren] | - | SC Freiburg [B-Junioren] | 0:0 | ||||
| 22. Spieltag | 05.05.2013 | SC Freiburg [B-Junioren] | - | TSV 1860 München [B-Junioren] | 4:0 | ||||
| 17. Spieltag | 09.05.2013 | 1. FC Nürnberg [B-Junioren] | - | SC Freiburg [B-Junioren] | 2:2 | ||||
| 24. Spieltag | 12.05.2013 | SC Freiburg [B-Junioren] | - | 1. FC Kaiserslautern [B-Junioren] | 3:0 | ||||
| 25. Spieltag | 26.05.2013 | FC Augsburg [B-Junioren] | - | SC Freiburg [B-Junioren] | 0:2 | ||||
| 26. Spieltag | 02.06.2013 | SC Freiburg [B-Junioren] | - | 1. FSV Mainz 05 [B-Junioren] | 3:1 |
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