| 4. Spieltag | 19.08.1998 | Spandauer SV | - | FC Berlin | 1:3 | ||||
| 6. Spieltag | 29.08.1998 | Stahl Eisenhüttenstadt | - | FC Berlin | 0:0 | ||||
| 7. Spieltag | 12.09.1998 | FC Berlin | - | SV Babelsberg 03 | 3:1 | ||||
| 8. Spieltag | 19.09.1998 | Sachsen Leipzig | - | FC Berlin | 4:4 | ||||
| 9. Spieltag | 26.09.1998 | FC Berlin | - | VfB Leipzig | 2:1 | ||||
| 11. Spieltag | 17.10.1998 | FC Berlin | - | VFC Plauen | 1:2 | ||||
| 15. Spieltag | 21.11.1998 | Lok Altmark Stendal | - | FC Berlin | 1:4 | ||||
| 17. Spieltag | 12.12.1998 | Rot-Weiß Erfurt | - | FC Berlin | 1:0 | ||||
| 18. Spieltag | 23.01.1999 | FC Carl Zeiss Jena | - | FC Berlin | 1:0 | ||||
| 19. Spieltag | 30.01.1999 | FC Berlin | - | Erzgebirge Aue | 2:0 | ||||
| 21. Spieltag | 13.02.1999 | FC Berlin | - | Spandauer SV | 1:0 | ||||
| 23. Spieltag | 27.02.1999 | FC Berlin | - | Stahl Eisenhüttenstadt | 6:1 | ||||
| 24. Spieltag | 06.03.1999 | SV Babelsberg 03 | - | FC Berlin | 0:0 | ||||
| 20. Spieltag | 10.03.1999 | FSV Zwickau | - | FC Berlin | 3:2 | ||||
| 25. Spieltag | 20.03.1999 | FC Berlin | - | Sachsen Leipzig | 1:1 | ||||
| 28. Spieltag | 05.04.1999 | VFC Plauen | - | FC Berlin | 2:0 |  |
|||
| 31. Spieltag | 24.04.1999 | FC Berlin | - | 1. FC Magdeburg | 1:2 |
Deutschland