| 7. Spieltag | 16.09.2016 | BFC Dynamo | - | Wacker Nordhausen | 3:0 |  |
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| 11. Spieltag | 23.10.2016 | FC Carl Zeiss Jena | - | Wacker Nordhausen | 0:0 | ||||
| 12. Spieltag | 29.10.2016 | Wacker Nordhausen | - | Union Fürstenwalde | 3:3 | ||||
| 25. Spieltag | 19.03.2017 | ZFC Meuselwitz | - | Wacker Nordhausen | 0:0 | ||||
| 19. Spieltag | 22.03.2017 | FC Oberlausitz | - | Wacker Nordhausen | 0:1 | ||||
| 18. Spieltag | 29.03.2017 | Wacker Nordhausen | - | SV Babelsberg 03 | 3:2 | ||||
| 26. Spieltag | 01.04.2017 | Wacker Nordhausen | - | VfB Auerbach | 0:2 | ||||
| 30. Spieltag | 23.04.2017 | Wacker Nordhausen | - | TSG Neustrelitz | 2:1 |  |
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| 20. Spieltag | 26.04.2017 | Wacker Nordhausen | - | 1. FC Lok Leipzig | 2:0 | |
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| 31. Spieltag | 30.04.2017 | Berliner AK 07 | - | Wacker Nordhausen | 1:1 | ||||
| 24. Spieltag | 03.05.2017 | Wacker Nordhausen | - | BFC Dynamo | 1:1 | ||||
| 32. Spieltag | 07.05.2017 | Wacker Nordhausen | - | Hertha BSC II | 2:2 | |
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| 33. Spieltag | 14.05.2017 | Energie Cottbus | - | Wacker Nordhausen | 2:0 |
Deutschland