1. Spieltag 15.08.2009 FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren] - Energie Cottbus [A-Junioren] 1:1
2. Spieltag 23.08.2009 Werder Bremen [A-Junioren] - FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren] 5:0
3. Spieltag 30.08.2009 FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren] - VfL Osnabrück [A-Junioren] 1:2
4. Spieltag 12.09.2009 Hansa Rostock [A-Junioren] - FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren] 2:0
5. Spieltag 26.09.2009 Rot-Weiß Erfurt [A-Junioren] - FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren] 0:1 Tor gelbe Karte
6. Spieltag 03.10.2009 FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren] - 1. FC Union Berlin [A-Junioren] 3:0 Tor
7. Spieltag 18.10.2009 VfL Wolfsburg [A-Junioren] - FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren] 6:2
8. Spieltag 01.11.2009 FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren] - Hamburger SV [A-Junioren] 2:3
9. Spieltag 07.11.2009 Hallescher FC [A-Junioren] - FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren] 3:1
10. Spieltag 15.11.2009 FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren] - Hertha BSC [A-Junioren] 2:3 Tor
11. Spieltag 22.11.2009 TeBe Berlin [A-Junioren] - FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren] 0:1
12. Spieltag 29.11.2009 FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren] - Hannover 96 [A-Junioren] 0:2 gelb-rote Karte
15. Spieltag 21.02.2010 FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren] - Werder Bremen [A-Junioren] 1:2
16. Spieltag 28.02.2010 VfL Osnabrück [A-Junioren] - FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren] 3:0
18. Spieltag 21.03.2010 FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren] - Rot-Weiß Erfurt [A-Junioren] 4:0 Tor
19. Spieltag 28.03.2010 1. FC Union Berlin [A-Junioren] - FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren] 1:0
17. Spieltag 31.03.2010 FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren] - Hansa Rostock [A-Junioren] 0:0
14. Spieltag 03.04.2010 Energie Cottbus [A-Junioren] - FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren] 1:0
21. Spieltag 17.04.2010 Hamburger SV [A-Junioren] - FC Carl Zeiss Jena [A-Junioren] 3:0