| 3. Spieltag | 10.08.2016 | Preußen Münster | - | MSV Duisburg | 1:1 |  |
|||
| 4. Spieltag | 13.08.2016 | MSV Duisburg | - | 1. FSV Mainz 05 II | 4:0 | ||||
| 6. Spieltag | 10.09.2016 | MSV Duisburg | - | Werder Bremen II | 1:0 | ||||
| 7. Spieltag | 16.09.2016 | SV Wehen Wiesbaden | - | MSV Duisburg | 3:0 | ||||
| 8. Spieltag | 20.09.2016 | MSV Duisburg | - | Holstein Kiel | 0:0 | |
|||
| 9. Spieltag | 25.09.2016 | Rot-Weiß Erfurt | - | MSV Duisburg | 0:1 | |
|||
| 11. Spieltag | 15.10.2016 | Jahn Regensburg | - | MSV Duisburg | 1:2 | ||||
| 14. Spieltag | 05.11.2016 | MSV Duisburg | - | Hallescher FC | 0:0 | |
|||
| 15. Spieltag | 19.11.2016 | FSV Frankfurt | - | MSV Duisburg | 0:0 | ||||
| 16. Spieltag | 26.11.2016 | MSV Duisburg | - | VfR Aalen | 2:2 | ||||
| 17. Spieltag | 04.12.2016 | Sportfreunde Lotte | - | MSV Duisburg | 0:2 |  |
|||
| 27. Spieltag | 14.03.2017 | Holstein Kiel | - | MSV Duisburg | 2:0 | ||||
| 36. Spieltag | 06.05.2017 | MSV Duisburg | - | Sportfreunde Lotte | 1:1 |
Deutschland
Türkei