| 12. Spieltag | 15.09.2012 | TSV 1860 Rosenheim | - | TSV 1896 Rain | 1:0 | ||||
| 16. Spieltag | 06.10.2012 | Eintracht Bamberg | - | TSV 1896 Rain | 3:1 | ||||
| 17. Spieltag | 13.10.2012 | TSV 1896 Rain | - | Bayern München II | 0:2 | ||||
| 23. Spieltag | 24.11.2012 | TSV 1896 Rain | - | Würzburger Kickers | 2:0 | ||||
| 29. Spieltag | 23.03.2013 | TSV 1896 Rain | - | FC Memmingen | 2:0 | ||||
| 26. Spieltag | 09.04.2013 | SV Heimstetten | - | TSV 1896 Rain | 2:0 | ||||
| 32. Spieltag | 14.04.2013 | 1. FC Nürnberg II | - | TSV 1896 Rain | 2:0 | ||||
| 25. Spieltag | 17.04.2013 | TSV 1896 Rain | - | SpVgg Bayern Hof | 1:3 | ||||
| 38. Spieltag | 24.05.2013 | SpVgg Greuther Fürth II | - | TSV 1896 Rain | 1:1 |  |
Deutschland