| 3. Spieltag | 21.08.2016 | FC Viktoria 1889 Berlin | - | Hertha BSC II | 1:1 |  |
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| 5. Spieltag | 28.08.2016 | FC Viktoria 1889 Berlin | - | FSV 63 Luckenwalde | 4:1 |  |
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| 6. Spieltag | 09.09.2016 | Wacker Nordhausen | - | FC Viktoria 1889 Berlin | 0:5 | ||||
| 8. Spieltag | 23.09.2016 | 1. FC Lok Leipzig | - | FC Viktoria 1889 Berlin | 2:2 | ||||
| 9. Spieltag | 02.10.2016 | FC Viktoria 1889 Berlin | - | RB Leipzig II | 1:0 | ||||
| 10. Spieltag | 16.10.2016 | FC Schönberg 95 | - | FC Viktoria 1889 Berlin | 2:4 | |
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| 11. Spieltag | 23.10.2016 | SV Babelsberg 03 | - | FC Viktoria 1889 Berlin | 4:1 | ||||
| 21. Spieltag | 29.03.2017 | FC Viktoria 1889 Berlin | - | Energie Cottbus | 0:0 | |
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