| 1. Spieltag | 15.08.2021 | Hertha Zehlendorf [B-Junioren] | - | FC St. Pauli [B-Junioren] | 0:1 | ||||
| 2. Spieltag | 22.08.2021 | FC St. Pauli [B-Junioren] | - | Hansa Rostock [B-Junioren] | 2:1 | ||||
| 3. Spieltag | 28.08.2021 | Chemnitzer FC [B-Junioren] | - | FC St. Pauli [B-Junioren] | 1:0 | ||||
| 4. Spieltag | 11.09.2021 | FC St. Pauli [B-Junioren] | - | FC Carl Zeiss Jena [B-Junioren] | 4:0 | ||||
| 5. Spieltag | 18.09.2021 | Hallescher FC [B-Junioren] | - | FC St. Pauli [B-Junioren] | 1:11 | ||||
| 6. Spieltag | 25.09.2021 | FC St. Pauli [B-Junioren] | - | 1. FC Union Berlin [B-Junioren] | 0:2 | ||||
| 7. Spieltag | 02.10.2021 | Hannover 96 [B-Junioren] | - | FC St. Pauli [B-Junioren] | 0:0 | ||||
| 8. Spieltag | 09.10.2021 | FC St. Pauli [B-Junioren] | - | Dynamo Dresden [B-Junioren] | 3:1 | ||||
| 9. Spieltag | 30.10.2021 | FC Viktoria 1889 Berlin [B-Junioren] | - | FC St. Pauli [B-Junioren] | 0:1 |  |
|||
| 10. Spieltag | 06.11.2021 | FC St. Pauli [B-Junioren] | - | Erzgebirge Aue [B-Junioren] | 5:0 | ||||
| 19. Spieltag | 24.04.2022 | FC St. Pauli [B-Junioren] | - | Hamburger SV [B-Junioren] | 1:3 |
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