| 1. Spieltag | 21.07.2012 | FV Illertissen | - | FC Ingolstadt 04 II | 2:2 |  |
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| 2. Spieltag | 25.07.2012 | FC Ingolstadt 04 II | - | TSV 1860 Rosenheim | 0:1 | ||||
| 3. Spieltag | 28.07.2012 | 1. FC Nürnberg II | - | FC Ingolstadt 04 II | 4:2 | ||||
| 5. Spieltag | 08.08.2012 | VfL Frohnlach | - | FC Ingolstadt 04 II | 1:1 | ||||
| 6. Spieltag | 11.08.2012 | FC Ingolstadt 04 II | - | Eintracht Bamberg | 4:1 | ||||
| 7. Spieltag | 15.08.2012 | Bayern München II | - | FC Ingolstadt 04 II | 1:0 | ||||
| 8. Spieltag | 18.08.2012 | FC Ingolstadt 04 II | - | FC Ismaning | 2:2 | ||||
| 9. Spieltag | 26.08.2012 | SpVgg Greuther Fürth II | - | FC Ingolstadt 04 II | 1:0 |
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