| 1. Spieltag | 07.08.2013 | TSG Neustrelitz | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:1 | ||||
| 2. Spieltag | 11.08.2013 | FC Carl Zeiss Jena | - | VFC Plauen | 4:2 | ||||
| 4. Spieltag | 24.08.2013 | FC Carl Zeiss Jena | - | FC Viktoria 1889 Berlin | 1:1 |  |
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| 9. Spieltag | 06.10.2013 | VfB Auerbach | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:4 | ||||
| 11. Spieltag | 26.10.2013 | Berliner AK 07 | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:2 | |
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| 12. Spieltag | 03.11.2013 | FC Carl Zeiss Jena | - | Germania Halberstadt | 2:0 | ||||
| 13. Spieltag | 10.11.2013 | 1. FC Union Berlin II | - | FC Carl Zeiss Jena | 3:3 |  |
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| 14. Spieltag | 23.11.2013 | ZFC Meuselwitz | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:2 | |
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| 15. Spieltag | 30.11.2013 | FC Carl Zeiss Jena | - | Optik Rathenow | 2:2 | |
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| 16. Spieltag | 08.12.2013 | FC Carl Zeiss Jena | - | TSG Neustrelitz | 3:1 | |
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| 17. Spieltag | 22.02.2014 | VFC Plauen | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:1 | ||||
| 18. Spieltag | 02.03.2014 | FC Carl Zeiss Jena | - | Wacker Nordhausen | 1:2 | ||||
| 19. Spieltag | 09.03.2014 | FC Viktoria 1889 Berlin | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:2 | |
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| 20. Spieltag | 16.03.2014 | FC Carl Zeiss Jena | - | 1. FC Magdeburg | 1:4 |
Deutschland