| 1. Spieltag | 12.08.2018 | FCE Rheine | - | SC Paderborn 07 II | 5:3 | ||||
| 2. Spieltag | 19.08.2018 | SC Paderborn 07 II | - | 1. FC Gievenbeck | 3:0 |  |
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| 14. Spieltag | 09.11.2018 | Rot Weiss Ahlen | - | SC Paderborn 07 II | 1:0 | ||||
| 15. Spieltag | 18.11.2018 | SC Paderborn 07 II | - | Westfalia Rhynern | 2:3 | ||||
| 16. Spieltag | 02.12.2018 | ASC 09 Dortmund | - | SC Paderborn 07 II | 3:1 | ||||
| 18. Spieltag | 14.12.2018 | SC Paderborn 07 II | - | FCE Rheine | 8:1 | ||||
| 19. Spieltag | 10.02.2019 | 1. FC Gievenbeck | - | SC Paderborn 07 II | 1:3 | |
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| 20. Spieltag | 17.02.2019 | FC Schalke 04 II | - | SC Paderborn 07 II | 1:1 | |
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| 21. Spieltag | 24.02.2019 | SC Paderborn 07 II | - | TuS Haltern | 2:2 |  |
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