1. Spieltag 12.08.2012 RB Leipzig - 1. FC Union Berlin II 1:1
2. Spieltag 26.08.2012 1. FC Union Berlin II - Energie Cottbus II 2:2
3. Spieltag 02.09.2012 FSV Zwickau - 1. FC Union Berlin II 4:0
4. Spieltag 14.09.2012 1. FC Union Berlin II - FC Carl Zeiss Jena 0:1
5. Spieltag 23.09.2012 Berliner AK 07 - 1. FC Union Berlin II 0:0
6. Spieltag 28.09.2012 1. FC Union Berlin II - 1. FC Magdeburg 0:3
7. Spieltag 07.10.2012 1. FC Union Berlin II - TSG Neustrelitz 0:0 gelbe Karte
8. Spieltag 21.10.2012 1. FC Lok Leipzig - 1. FC Union Berlin II 0:5
9. Spieltag 27.10.2012 1. FC Union Berlin II - Optik Rathenow 2:1
10. Spieltag 04.11.2012 Germania Halberstadt - 1. FC Union Berlin II 1:1
20. Spieltag 17.03.2013 1. FC Union Berlin II - Berliner AK 07 1:2
17. Spieltag 24.03.2013 Energie Cottbus II - 1. FC Union Berlin II 4:1
22. Spieltag 30.03.2013 TSG Neustrelitz - 1. FC Union Berlin II 0:0
16. Spieltag 03.04.2013 1. FC Union Berlin II - RB Leipzig 1:2 gelbe Karte
23. Spieltag 07.04.2013 1. FC Union Berlin II - 1. FC Lok Leipzig 0:1
21. Spieltag 10.04.2013 1. FC Magdeburg - 1. FC Union Berlin II 1:2 gelbe Karte
24. Spieltag 14.04.2013 Optik Rathenow - 1. FC Union Berlin II 3:2 gelbe Karte
15. Spieltag 17.04.2013 1. FC Union Berlin II - Torgelower SV Greif 3:1
25. Spieltag 21.04.2013 1. FC Union Berlin II - Germania Halberstadt 1:1 gelbe Karte
14. Spieltag 02.05.2013 Hertha BSC II - 1. FC Union Berlin II 1:3
27. Spieltag 05.05.2013 1. FC Union Berlin II - ZFC Meuselwitz 2:0 Tor
18. Spieltag 08.05.2013 1. FC Union Berlin II - FSV Zwickau 1:3 gelbe Karte
28. Spieltag 11.05.2013 VFC Plauen - 1. FC Union Berlin II 2:2
19. Spieltag 15.05.2013 FC Carl Zeiss Jena - 1. FC Union Berlin II 1:0
29. Spieltag 19.05.2013 1. FC Union Berlin II - Hertha BSC II 0:1 gelbe Karte
30. Spieltag 25.05.2013 Torgelower SV Greif - 1. FC Union Berlin II 0:3