1. Spieltag 01.08.1998 FC Berlin - FC Carl Zeiss Jena 0:0
2. Spieltag 09.08.1998 Erzgebirge Aue - FC Berlin 0:1
3. Spieltag 12.08.1998 FC Berlin - FSV Zwickau 0:0
4. Spieltag 19.08.1998 Spandauer SV - FC Berlin 1:3 gelbe Karte
5. Spieltag 22.08.1998 FC Berlin - SD Croatia Berlin 2:1 gelbe Karte
6. Spieltag 29.08.1998 Stahl Eisenhüttenstadt - FC Berlin 0:0
7. Spieltag 12.09.1998 FC Berlin - SV Babelsberg 03 3:1 Tor
8. Spieltag 19.09.1998 Sachsen Leipzig - FC Berlin 4:4 gelbe Karte
9. Spieltag 26.09.1998 FC Berlin - VfB Leipzig 2:1
10. Spieltag 10.10.1998 Dynamo Dresden - FC Berlin 2:1
11. Spieltag 17.10.1998 FC Berlin - VFC Plauen 1:2
12. Spieltag 24.10.1998 Chemnitzer FC - FC Berlin 1:1 Tor
13. Spieltag 07.11.1998 FC Berlin - Dresdner SC 1:0
15. Spieltag 21.11.1998 Lok Altmark Stendal - FC Berlin 1:4
16. Spieltag 05.12.1998 FC Berlin - 1. FC Union Berlin 0:3
17. Spieltag 12.12.1998 Rot-Weiß Erfurt - FC Berlin 1:0 gelbe Karte
18. Spieltag 23.01.1999 FC Carl Zeiss Jena - FC Berlin 1:0
19. Spieltag 30.01.1999 FC Berlin - Erzgebirge Aue 2:0 Tor
21. Spieltag 13.02.1999 FC Berlin - Spandauer SV 1:0
23. Spieltag 27.02.1999 FC Berlin - Stahl Eisenhüttenstadt 6:1 Tor
24. Spieltag 06.03.1999 SV Babelsberg 03 - FC Berlin 0:0
20. Spieltag 10.03.1999 FSV Zwickau - FC Berlin 3:2
22. Spieltag 17.03.1999 SD Croatia Berlin - FC Berlin 0:1 gelbe Karte
25. Spieltag 20.03.1999 FC Berlin - Sachsen Leipzig 1:1
26. Spieltag 27.03.1999 VfB Leipzig - FC Berlin 0:0
27. Spieltag 02.04.1999 FC Berlin - Dynamo Dresden 2:1 Tor
28. Spieltag 05.04.1999 VFC Plauen - FC Berlin 2:0 gelbe Karte
29. Spieltag 10.04.1999 FC Berlin - Chemnitzer FC 0:2 gelbe Karte
30. Spieltag 17.04.1999 Dresdner SC - FC Berlin 1:2
31. Spieltag 24.04.1999 FC Berlin - 1. FC Magdeburg 1:2
32. Spieltag 05.05.1999 FC Berlin - Lok Altmark Stendal 0:1
33. Spieltag 08.05.1999 1. FC Union Berlin - FC Berlin 0:2 gelbe Karte
34. Spieltag 15.05.1999 FC Berlin - Rot-Weiß Erfurt 3:1