1. Spieltag 01.08.1998 SD Croatia Berlin - 1. FC Magdeburg 0:2
2. Spieltag 08.08.1998 1. FC Magdeburg - SV Babelsberg 03 1:0
3. Spieltag 14.08.1998 VfB Leipzig - 1. FC Magdeburg 1:1
4. Spieltag 19.08.1998 1. FC Magdeburg - VFC Plauen 2:2 gelbe Karte
5. Spieltag 22.08.1998 Dresdner SC - 1. FC Magdeburg 1:1 Tor gelbe Karte
6. Spieltag 02.09.1998 1. FC Magdeburg - Lok Altmark Stendal 4:2
7. Spieltag 13.09.1998 Rot-Weiß Erfurt - 1. FC Magdeburg 1:1 Tor gelbe Karte
8. Spieltag 19.09.1998 1. FC Magdeburg - Erzgebirge Aue 1:0 gelb-rote Karte
9. Spieltag 27.09.1998 Spandauer SV - 1. FC Magdeburg 2:1
10. Spieltag 11.10.1998 1. FC Magdeburg - Stahl Eisenhüttenstadt 3:0
11. Spieltag 17.10.1998 Sachsen Leipzig - 1. FC Magdeburg 1:3 gelbe Karte
12. Spieltag 25.10.1998 1. FC Magdeburg - Dynamo Dresden 1:0 gelbe Karte
13. Spieltag 07.11.1998 Chemnitzer FC - 1. FC Magdeburg 1:0 gelbe Karte
16. Spieltag 05.12.1998 FC Carl Zeiss Jena - 1. FC Magdeburg 2:0
17. Spieltag 11.12.1998 1. FC Magdeburg - FSV Zwickau 2:1
20. Spieltag 05.02.1999 1. FC Magdeburg - VfB Leipzig 1:0 gelbe Karte
21. Spieltag 13.02.1999 VFC Plauen - 1. FC Magdeburg 0:0 gelb-rote Karte
22. Spieltag 23.02.1999 1. FC Magdeburg - Dresdner SC 4:0
23. Spieltag 28.02.1999 Lok Altmark Stendal - 1. FC Magdeburg 0:1
25. Spieltag 20.03.1999 Erzgebirge Aue - 1. FC Magdeburg 0:0 gelbe Karte
26. Spieltag 28.03.1999 1. FC Magdeburg - Spandauer SV 0:1 gelbe Karte
27. Spieltag 31.03.1999 Stahl Eisenhüttenstadt - 1. FC Magdeburg 1:3
29. Spieltag 09.04.1999 Dynamo Dresden - 1. FC Magdeburg 0:0
30. Spieltag 18.04.1999 1. FC Magdeburg - Chemnitzer FC 0:1 gelbe Karte
31. Spieltag 24.04.1999 FC Berlin - 1. FC Magdeburg 1:2
24. Spieltag 28.04.1999 1. FC Magdeburg - Rot-Weiß Erfurt 1:1
32. Spieltag 05.05.1999 1. FC Magdeburg - 1. FC Union Berlin 3:2 gelbe Karte
33. Spieltag 08.05.1999 1. FC Magdeburg - FC Carl Zeiss Jena 4:2 gelbe Karte
34. Spieltag 15.05.1999 FSV Zwickau - 1. FC Magdeburg 1:1