| 4. Spieltag | 13.08.2016 | Fortuna Düsseldorf II | - | Bor. Mönchengladbach II | 0:1 | ||||
| 6. Spieltag | 27.08.2016 | SV Rödinghausen | - | Fortuna Düsseldorf II | 2:1 | ||||
| 9. Spieltag | 17.09.2016 | Fortuna Düsseldorf II | - | Alemannia Aachen | 1:1 | ||||
| 10. Spieltag | 24.09.2016 | Borussia Dortmund II | - | Fortuna Düsseldorf II | 2:2 |  |
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| 13. Spieltag | 16.10.2016 | Fortuna Düsseldorf II | - | Sportfreunde Siegen | 2:2 | |
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| 16. Spieltag | 05.11.2016 | TSG Sprockhövel | - | Fortuna Düsseldorf II | 3:3 | ||||
| 17. Spieltag | 12.11.2016 | Fortuna Düsseldorf II | - | SC Wiedenbrück | 1:2 | ||||
| 20. Spieltag | 10.12.2016 | Fortuna Düsseldorf II | - | Viktoria Köln | 1:1 |
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