| 1. Spieltag | 29.07.2015 | FV Illertissen | - | Bayern München II | 1:1 | ||||
| 3. Spieltag | 02.08.2015 | Bayern München II | - | TSV 1860 München II | 0:0 | ||||
| 2. Spieltag | 25.08.2015 | SpVgg Bayreuth | - | Bayern München II | 1:2 | ||||
| 16. Spieltag | 23.10.2015 | FC Augsburg II | - | Bayern München II | 1:4 | ||||
| 8. Spieltag | 02.12.2015 | Bayern München II | - | SpVgg Unterhaching | 1:1 |  |
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| 19. Spieltag | 21.02.2016 | Bayern München II | - | SpVgg Bayreuth | 0:1 | ||||
| 23. Spieltag | 05.03.2016 | Wacker Burghausen | - | Bayern München II | 1:0 | |
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| 24. Spieltag | 11.03.2016 | Bayern München II | - | SV Schalding-Heining | 2:0 | ||||
| 27. Spieltag | 01.04.2016 | Bayern München II | - | SpVgg Greuther Fürth II | 0:2 | ||||
| 28. Spieltag | 11.04.2016 | 1. FC Nürnberg II | - | Bayern München II | 1:0 | ||||
| 29. Spieltag | 15.04.2016 | Bayern München II | - | Viktoria Aschaffenburg | 1:1 | ||||
| 31. Spieltag | 29.04.2016 | Bayern München II | - | Jahn Regensburg | 1:0 | ||||
| 34. Spieltag | 21.05.2016 | FC Amberg | - | Bayern München II | 1:4 |
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