1. Spieltag 13.08.2006 FC Gütersloh 2000 - FC Schalke 04 II 2:0
2. Spieltag 18.08.2006 SG Wattenscheid 09 - FC Gütersloh 2000 0:0
3. Spieltag 27.08.2006 Sportfreunde Lotte - FC Gütersloh 2000 3:4
4. Spieltag 03.09.2006 FC Gütersloh 2000 - SV Lippstadt 08 2:0
5. Spieltag 10.09.2006 Hammer SpVg - FC Gütersloh 2000 0:4
6. Spieltag 15.09.2006 FC Gütersloh 2000 - SF Oestrich-Iserlohn 0:0
7. Spieltag 24.09.2006 SpVgg Erkenschwick - FC Gütersloh 2000 1:2
8. Spieltag 29.09.2006 FC Gütersloh 2000 - Arminia Bielefeld II 1:3
9. Spieltag 15.10.2006 SV Emsdetten 05 - FC Gütersloh 2000 1:3
10. Spieltag 22.10.2006 FC Gütersloh 2000 - VfL Bochum II 2:1 Tor
11. Spieltag 29.10.2006 SC Verl - FC Gütersloh 2000 5:2
12. Spieltag 05.11.2006 FC Gütersloh 2000 - Delbrücker SC 3:0 TorTor
13. Spieltag 12.11.2006 Rot Weiss Ahlen II - FC Gütersloh 2000 0:0
14. Spieltag 19.11.2006 FC Gütersloh 2000 - Westfalia Herne 1:0
15. Spieltag 03.12.2006 VfB Hüls - FC Gütersloh 2000 1:0
16. Spieltag 10.12.2006 FC Gütersloh 2000 - Preußen Münster 0:1
23. Spieltag 11.03.2007 SF Oestrich-Iserlohn - FC Gütersloh 2000 0:2
24. Spieltag 18.03.2007 FC Gütersloh 2000 - SpVgg Erkenschwick 4:1
25. Spieltag 25.03.2007 Arminia Bielefeld II - FC Gütersloh 2000 0:1
26. Spieltag 01.04.2007 FC Gütersloh 2000 - SV Emsdetten 05 1:1
22. Spieltag 05.04.2007 FC Gütersloh 2000 - Hammer SpVg 2:1
27. Spieltag 15.04.2007 VfL Bochum II - FC Gütersloh 2000 0:1
28. Spieltag 22.04.2007 FC Gütersloh 2000 - SC Verl 4:1
29. Spieltag 29.04.2007 Delbrücker SC - FC Gütersloh 2000 1:1
30. Spieltag 06.05.2007 FC Gütersloh 2000 - Rot Weiss Ahlen II 1:3 rote Karte