1. Spieltag 01.08.1998 SD Croatia Berlin - 1. FC Magdeburg 0:2
2. Spieltag 08.08.1998 1. FC Magdeburg - SV Babelsberg 03 1:0
3. Spieltag 14.08.1998 VfB Leipzig - 1. FC Magdeburg 1:1
4. Spieltag 19.08.1998 1. FC Magdeburg - VFC Plauen 2:2
5. Spieltag 22.08.1998 Dresdner SC - 1. FC Magdeburg 1:1
7. Spieltag 13.09.1998 Rot-Weiß Erfurt - 1. FC Magdeburg 1:1
8. Spieltag 19.09.1998 1. FC Magdeburg - Erzgebirge Aue 1:0
9. Spieltag 27.09.1998 Spandauer SV - 1. FC Magdeburg 2:1
10. Spieltag 11.10.1998 1. FC Magdeburg - Stahl Eisenhüttenstadt 3:0 TorTor
11. Spieltag 17.10.1998 Sachsen Leipzig - 1. FC Magdeburg 1:3 Tor
12. Spieltag 25.10.1998 1. FC Magdeburg - Dynamo Dresden 1:0 gelbe Karte
13. Spieltag 07.11.1998 Chemnitzer FC - 1. FC Magdeburg 1:0
14. Spieltag 14.11.1998 1. FC Magdeburg - FC Berlin 4:2 Tor
16. Spieltag 05.12.1998 FC Carl Zeiss Jena - 1. FC Magdeburg 2:0
17. Spieltag 11.12.1998 1. FC Magdeburg - FSV Zwickau 2:1
18. Spieltag 24.01.1999 1. FC Magdeburg - SD Croatia Berlin 4:2
19. Spieltag 30.01.1999 SV Babelsberg 03 - 1. FC Magdeburg 1:1
21. Spieltag 13.02.1999 VFC Plauen - 1. FC Magdeburg 0:0
23. Spieltag 28.02.1999 Lok Altmark Stendal - 1. FC Magdeburg 0:1
26. Spieltag 28.03.1999 1. FC Magdeburg - Spandauer SV 0:1
27. Spieltag 31.03.1999 Stahl Eisenhüttenstadt - 1. FC Magdeburg 1:3 Tor
28. Spieltag 03.04.1999 1. FC Magdeburg - Sachsen Leipzig 2:1
29. Spieltag 09.04.1999 Dynamo Dresden - 1. FC Magdeburg 0:0
30. Spieltag 18.04.1999 1. FC Magdeburg - Chemnitzer FC 0:1
31. Spieltag 24.04.1999 FC Berlin - 1. FC Magdeburg 1:2
24. Spieltag 28.04.1999 1. FC Magdeburg - Rot-Weiß Erfurt 1:1
32. Spieltag 05.05.1999 1. FC Magdeburg - 1. FC Union Berlin 3:2
34. Spieltag 15.05.1999 FSV Zwickau - 1. FC Magdeburg 1:1