| 3. Spieltag | 13.08.2023 | SC Paderborn 07 II | - | Fortuna Köln | 1:2 | ||||
| 4. Spieltag | 19.08.2023 | Rot Weiss Ahlen | - | SC Paderborn 07 II | 1:1 | ||||
| 6. Spieltag | 02.09.2023 | 1. FC Düren | - | SC Paderborn 07 II | 2:0 | ||||
| 8. Spieltag | 22.09.2023 | Bor. Mönchengladbach II | - | SC Paderborn 07 II | 2:1 | ||||
| 9. Spieltag | 02.10.2023 | SC Paderborn 07 II | - | FC Schalke 04 II | 2:2 | ||||
| 10. Spieltag | 07.10.2023 | SV Rödinghausen | - | SC Paderborn 07 II | 2:0 | ||||
| 15. Spieltag | 10.11.2023 | SSVg Velbert | - | SC Paderborn 07 II | 2:2 | ||||
| 19. Spieltag | 09.12.2023 | SC Paderborn 07 II | - | Fortuna Düsseldorf II | 1:3 | ||||
| 18. Spieltag | 27.01.2024 | FC Gütersloh | - | SC Paderborn 07 II | 1:3 | ||||
| 31. Spieltag | 27.04.2024 | SC Wiedenbrück | - | SC Paderborn 07 II | 1:1 |  |
|||
| 33. Spieltag | 10.05.2024 | SV Lippstadt 08 | - | SC Paderborn 07 II | 0:0 | ||||
| 34. Spieltag | 18.05.2024 | SC Paderborn 07 II | - | Rot-Weiß Oberhausen | 1:1 |
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