# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Ingolstadt 04 II, Deutschland FC Ingolstadt 04 II 16 12 1 3 36:17 19 37
2 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 17 11 3 3 33:14 19 36
3 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 17 10 5 2 42:19 23 35
4 FC Ismaning, Deutschland FC Ismaning 17 9 7 1 38:23 15 34
5 Würzburger FV, Deutschland Würzburger FV 17 10 3 4 36:25 11 33
6 SpVgg Unterhaching II, Deutschland SpVgg Unterhaching II 17 10 2 5 30:14 16 32
7 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 17 9 2 6 29:25 4 29
8 SpVgg Bayern Hof, Deutschland SpVgg Bayern Hof 16 7 6 3 26:15 11 27
9 TSV Großbardorf, Deutschland TSV Großbardorf 17 7 6 4 32:27 5 27
10 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 16 8 3 5 26:23 3 27
11 Eintracht Bamberg, Deutschland Eintracht Bamberg 17 8 3 6 23:28 -5 27
12 SV Seligenporten, Deutschland SV Seligenporten 16 7 4 5 31:28 3 25
13 FSV Erlangen-Bruck, Deutschland FSV Erlangen-Bruck 17 6 5 6 34:29 5 23
14 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 16 6 2 8 23:20 3 20
15 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 16 5 5 6 26:25 1 20
16 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 16 5 4 7 27:27 0 19
17 TSV Aindling, Deutschland TSV Aindling 16 5 4 7 14:16 -2 19
18 Freier TuS Regensburg, Deutschland Freier TuS Regensburg 16 1 4 11 21:36 -15 7
  Aufstieg
  Relegation
  Abstieg

# Bayern Hof wurden wegen eines schweren Falles der Verletzung der Platzordnung zwei Punkte abgezogen. Später wurde das Urteil zurückgenommen.

# Zwar ist der FC Ismaning sportlich aufgestiegen, doch es wurde keine Lizenz für die Regionalliga beantragt. Somit steigt die Reserve des FC Ingolstadt auf.