1. Spieltag 13.08.2016 ASC 09 Dortmund - FC Brünninghausen 1:3
2. Spieltag 21.08.2016 FC Brünninghausen - 1. FC Kaan-Marienborn 2:2 gelbe Karte
3. Spieltag 28.08.2016 SC Paderborn 07 II - FC Brünninghausen 1:0
4. Spieltag 04.09.2016 FC Brünninghausen - SuS Stadtlohn 4:0
5. Spieltag 10.09.2016 TuS Erndtebrück - FC Brünninghausen 0:0
6. Spieltag 18.09.2016 FC Brünninghausen - Roland Beckum 3:0
7. Spieltag 25.09.2016 Hammer SpVg - FC Brünninghausen 2:0
8. Spieltag 02.10.2016 FCE Rheine - FC Brünninghausen 3:1
9. Spieltag 09.10.2016 TSV Marl-Hüls - FC Brünninghausen 2:1
10. Spieltag 16.10.2016 FC Brünninghausen - SC Hassel 0:2
11. Spieltag 23.10.2016 SpVgg Erkenschwick - FC Brünninghausen 1:4
12. Spieltag 30.10.2016 FC Brünninghausen - FC Gütersloh 2000 0:0
13. Spieltag 06.11.2016 Arminia Bielefeld II - FC Brünninghausen 7:0
14. Spieltag 12.11.2016 FC Brünninghausen - SV Lippstadt 08 1:2
15. Spieltag 27.11.2016 Westfalia Rhynern - FC Brünninghausen 0:0
16. Spieltag 04.12.2016 FC Brünninghausen - SuS Neuenkir­chen 2:4
17. Spieltag 11.12.2016 TuS Ennepetal - FC Brünninghausen 1:1
18. Spieltag 17.12.2016 FC Brünninghausen - ASC 09 Dortmund 1:1
22. Spieltag 12.03.2017 FC Brünninghausen - TuS Erndtebrück 0:0
23. Spieltag 19.03.2017 Roland Beckum - FC Brünninghausen 1:3
24. Spieltag 26.03.2017 FC Brünninghausen - Hammer SpVg 0:1
25. Spieltag 02.04.2017 FC Brünninghausen - FCE Rheine 4:3
26. Spieltag 09.04.2017 FC Brünninghausen - TSV Marl-Hüls 4:2
27. Spieltag 13.04.2017 SC Hassel - FC Brünninghausen 2:0
28. Spieltag 17.04.2017 FC Brünninghausen - SpVgg Erkenschwick 2:0
30. Spieltag 30.04.2017 FC Brünninghausen - Arminia Bielefeld II 3:2
31. Spieltag 07.05.2017 SV Lippstadt 08 - FC Brünninghausen 1:1
32. Spieltag 14.05.2017 FC Brünninghausen - Westfalia Rhynern 0:0
33. Spieltag 21.05.2017 SuS Neuenkir­chen - FC Brünninghausen 2:0
34. Spieltag 26.05.2017 FC Brünninghausen - TuS Ennepetal 1:2