3. Spieltag 28.08.2016 TSV Marl-Hüls - FC Gütersloh 2000 3:2 gelbe Karte
4. Spieltag 04.09.2016 FC Gütersloh 2000 - SC Hassel 2:0
5. Spieltag 11.09.2016 SpVgg Erkenschwick - FC Gütersloh 2000 0:0
6. Spieltag 18.09.2016 FC Gütersloh 2000 - ASC 09 Dortmund 4:2
7. Spieltag 25.09.2016 FC Gütersloh 2000 - Arminia Bielefeld II 4:2
8. Spieltag 02.10.2016 SV Lippstadt 08 - FC Gütersloh 2000 1:1
9. Spieltag 09.10.2016 FC Gütersloh 2000 - Westfalia Rhynern 0:4
10. Spieltag 16.10.2016 SuS Neuenkir­chen - FC Gütersloh 2000 2:1
12. Spieltag 30.10.2016 FC Brünninghausen - FC Gütersloh 2000 0:0
13. Spieltag 06.11.2016 FC Gütersloh 2000 - 1. FC Kaan-Marienborn 2:0 Tor
14. Spieltag 13.11.2016 SC Paderborn 07 II - FC Gütersloh 2000 3:1
15. Spieltag 27.11.2016 FC Gütersloh 2000 - SuS Stadtlohn 2:1
16. Spieltag 04.12.2016 TuS Erndtebrück - FC Gütersloh 2000 5:3
17. Spieltag 11.12.2016 FC Gütersloh 2000 - Roland Beckum 1:1
19. Spieltag 25.02.2017 FCE Rheine - FC Gütersloh 2000 2:0 gelbe Karte
21. Spieltag 05.03.2017 SC Hassel - FC Gütersloh 2000 1:3
22. Spieltag 12.03.2017 FC Gütersloh 2000 - SpVgg Erkenschwick 4:0 Tor
23. Spieltag 19.03.2017 ASC 09 Dortmund - FC Gütersloh 2000 1:1
25. Spieltag 02.04.2017 FC Gütersloh 2000 - SV Lippstadt 08 4:2
26. Spieltag 09.04.2017 Westfalia Rhynern - FC Gütersloh 2000 3:2
28. Spieltag 17.04.2017 TuS Ennepetal - FC Gütersloh 2000 2:1
29. Spieltag 23.04.2017 FC Gütersloh 2000 - FC Brünninghausen 1:1
27. Spieltag 26.04.2017 FC Gütersloh 2000 - SuS Neuenkir­chen 1:0
30. Spieltag 30.04.2017 1. FC Kaan-Marienborn - FC Gütersloh 2000 1:0
31. Spieltag 05.05.2017 FC Gütersloh 2000 - SC Paderborn 07 II 3:1
32. Spieltag 14.05.2017 SuS Stadtlohn - FC Gütersloh 2000 1:1
34. Spieltag 28.05.2017 Roland Beckum - FC Gütersloh 2000 3:2