1. Spieltag 13.08.2016 1. FC Union Berlin [B-Junioren] - Hertha BSC [B-Junioren] 1:1 gelbe Karte
2. Spieltag 20.08.2016 1. FC Magdeburg [B-Junioren] - 1. FC Union Berlin [B-Junioren] 2:1 gelbe Karte
3. Spieltag 27.08.2016 1. FC Union Berlin [B-Junioren] - Werder Bremen [B-Junioren] 0:4 gelbe Karte
4. Spieltag 03.09.2016 RB Leipzig [B-Junioren] - 1. FC Union Berlin [B-Junioren] 9:0 gelbe Karte
5. Spieltag 17.09.2016 1. FC Union Berlin [B-Junioren] - Dynamo Dresden [B-Junioren] 3:2
9. Spieltag 02.10.2016 Holstein Kiel [B-Junioren] - 1. FC Union Berlin [B-Junioren] 4:0 gelbe Karte
8. Spieltag 15.10.2016 VfL Wolfsburg [B-Junioren] - 1. FC Union Berlin [B-Junioren] 1:5 Tor
10. Spieltag 30.10.2016 1. FC Union Berlin [B-Junioren] - Hamburger SV [B-Junioren] 1:4
11. Spieltag 06.11.2016 Hansa Rostock [B-Junioren] - 1. FC Union Berlin [B-Junioren] 2:1 gelbe Karte
12. Spieltag 12.11.2016 1. FC Union Berlin [B-Junioren] - Eintracht Braunschweig [B-Junioren] 2:1 gelbe Karte
13. Spieltag 26.11.2016 TeBe Berlin [B-Junioren] - 1. FC Union Berlin [B-Junioren] 1:2 gelbe Karte
15. Spieltag 10.12.2016 1. FC Union Berlin [B-Junioren] - 1. FC Magdeburg [B-Junioren] 3:3
16. Spieltag 18.12.2016 Werder Bremen [B-Junioren] - 1. FC Union Berlin [B-Junioren] 1:0 gelbe Karte
17. Spieltag 19.02.2017 1. FC Union Berlin [B-Junioren] - RB Leipzig [B-Junioren] 2:6
18. Spieltag 25.02.2017 Dynamo Dresden [B-Junioren] - 1. FC Union Berlin [B-Junioren] 3:4
19. Spieltag 05.03.2017 1. FC Union Berlin [B-Junioren] - FC St. Pauli [B-Junioren] 0:1 gelb-rote Karte
22. Spieltag 02.04.2017 1. FC Union Berlin [B-Junioren] - Holstein Kiel [B-Junioren] 0:1
24. Spieltag 22.04.2017 1. FC Union Berlin [B-Junioren] - Hansa Rostock [B-Junioren] 2:0
25. Spieltag 21.05.2017 Eintracht Braunschweig [B-Junioren] - 1. FC Union Berlin [B-Junioren] 0:4
26. Spieltag 27.05.2017 1. FC Union Berlin [B-Junioren] - TeBe Berlin [B-Junioren] 0:1