# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Einheit Rudolstadt, Deutschland FC Einheit Rudolstadt 6 4 2 0 12:4 8 14
2 Bischofswerdaer FV, Deutschland Bischofswerdaer FV 5 4 1 0 13:3 10 13
3 1. FC Lok Leipzig, Deutschland 1. FC Lok Leipzig 5 4 1 0 12:4 8 13
4 Inter Leipzig, Deutschland Inter Leipzig 6 4 0 2 12:8 4 12
5 Energie Cottbus II, Deutschland Energie Cottbus II 6 4 0 2 12:10 2 12
6 VfL Halle 96, Deutschland VfL Halle 96 5 3 1 1 14:5 9 10
7 Union Sandersdorf, Deutschland Union Sandersdorf 5 3 1 1 10:5 5 10
8 FC Carl Zeiss Jena II, Deutschland FC Carl Zeiss Jena II 5 3 0 2 15:8 7 9
9 SSV Markranstädt, Deutschland SSV Markranstädt 6 2 1 3 11:14 -3 7
10 SV SCHOTT Jena, Deutschland SV SCHOTT Jena 6 2 0 4 7:11 -4 6
11 Askania Bernburg, Deutschland Askania Bernburg 6 0 3 3 6:12 -6 3
12 Rot-Weiß Erfurt II, Deutschland Rot-Weiß Erfurt II 5 0 2 3 4:11 -7 2
13 BSG Wismut Gera, Deutschland BSG Wismut Gera 6 0 2 4 9:18 -9 2
14 FSV Barleben, Deutschland FSV Barleben 5 0 1 4 3:13 -10 1
15 FC Eisenach, Deutschland FC Eisenach 6 0 1 5 5:17 -12 1
16 VFC Plauen, Deutschland VFC Plauen 5 0 1 4 2:21 -19 1
  Aufstieg
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt II und Energie Cottbus II wurden zum Saisonende zurückgezogen. Dadurch verringerte sich die Zahl der sportlichen Absteiger.

# Der FC Eisenach beantragte für die Saison 2016/2017 keine Oberligalizenz