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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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1. FC Lok Leipzig | 12 | 7 | 5 | 0 | 25:6 | 19 | 26 |
| 2 |
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Bischofswerdaer FV | 13 | 6 | 5 | 2 | 19:10 | 9 | 23 |
| 3 |
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Inter Leipzig | 12 | 7 | 1 | 4 | 20:13 | 7 | 22 |
| 4 |
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Union Sandersdorf | 12 | 7 | 1 | 4 | 21:16 | 5 | 22 |
| 5 |
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FC Einheit Rudolstadt | 12 | 5 | 5 | 2 | 19:11 | 8 | 20 |
| 6 |
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Askania Bernburg | 13 | 4 | 5 | 4 | 18:19 | -1 | 17 |
| 7 |
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FC Carl Zeiss Jena II | 12 | 4 | 4 | 4 | 24:21 | 3 | 16 |
| 8 |
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Energie Cottbus II | 12 | 5 | 1 | 6 | 16:25 | -9 | 16 |
| 9 |
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VfL Halle 96 | 11 | 4 | 2 | 5 | 27:20 | 7 | 14 |
| 10 |
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SSV Markranstädt | 11 | 4 | 2 | 5 | 16:24 | -8 | 14 |
| 11 |
|
FSV Barleben | 11 | 3 | 2 | 6 | 17:20 | -3 | 11 |
| 12 |
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Rot-Weiß Erfurt II | 12 | 2 | 3 | 7 | 14:34 | -20 | 9 |
| 13 |
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SV SCHOTT Jena | 13 | 2 | 1 | 10 | 12:31 | -19 | 7 |
| 14 |
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VFC Plauen | 12 | 1 | 2 | 9 | 8:41 | -33 | 5 |
| 15 |
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BSG Wismut Gera | 12 | 0 | 3 | 9 | 11:34 | -23 | 3 |
| 16 |
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FC Eisenach | 12 | 0 | 1 | 11 | 7:46 | -39 | 1 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Rot-Weiß Erfurt II und Energie Cottbus II wurden zum Saisonende zurückgezogen. Dadurch verringerte sich die Zahl der sportlichen Absteiger. # Der FC Eisenach beantragte für die Saison 2016/2017 keine Oberligalizenz |
