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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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1. FC Lok Leipzig | 14 | 9 | 5 | 0 | 29:6 | 23 | 32 |
| 2 |
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Bischofswerdaer FV | 14 | 7 | 5 | 2 | 22:10 | 12 | 26 |
| 3 |
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Inter Leipzig | 14 | 8 | 2 | 4 | 25:15 | 10 | 26 |
| 4 |
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FC Einheit Rudolstadt | 14 | 6 | 5 | 3 | 24:15 | 9 | 23 |
| 5 |
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Union Sandersdorf | 13 | 7 | 1 | 5 | 21:17 | 4 | 22 |
| 6 |
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FC Carl Zeiss Jena II | 13 | 5 | 4 | 4 | 27:23 | 4 | 19 |
| 7 |
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Askania Bernburg | 14 | 4 | 5 | 5 | 20:23 | -3 | 17 |
| 8 |
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Energie Cottbus II | 14 | 5 | 1 | 8 | 17:34 | -17 | 16 |
| 9 |
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VfL Halle 96 | 13 | 4 | 3 | 6 | 30:24 | 6 | 15 |
| 10 |
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SSV Markranstädt | 13 | 4 | 3 | 6 | 17:26 | -9 | 15 |
| 11 |
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Rot-Weiß Erfurt II | 13 | 3 | 3 | 7 | 16:34 | -18 | 12 |
| 12 |
|
FSV Barleben | 12 | 3 | 2 | 7 | 17:21 | -4 | 11 |
| 13 |
|
SV SCHOTT Jena | 14 | 2 | 2 | 10 | 12:31 | -19 | 8 |
| 14 |
|
VFC Plauen | 13 | 2 | 2 | 9 | 9:41 | -32 | 8 |
| 15 |
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BSG Wismut Gera | 14 | 0 | 4 | 10 | 12:39 | -27 | 4 |
| 16 |
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FC Eisenach | 14 | 0 | 1 | 13 | 8:52 | -44 | 1 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Rot-Weiß Erfurt II und Energie Cottbus II wurden zum Saisonende zurückgezogen. Dadurch verringerte sich die Zahl der sportlichen Absteiger. # Der FC Eisenach beantragte für die Saison 2016/2017 keine Oberligalizenz |
