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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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1. FC Lok Leipzig | 15 | 12 | 3 | 0 | 44:8 | 36 | 39 |
| 2 |
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Inter Leipzig | 15 | 11 | 3 | 1 | 45:13 | 32 | 36 |
| 3 |
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Bischofswerdaer FV | 15 | 9 | 3 | 3 | 37:20 | 17 | 30 |
| 4 |
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FC Carl Zeiss Jena II | 15 | 8 | 3 | 4 | 38:18 | 20 | 27 |
| 5 |
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FSV Barleben | 15 | 7 | 4 | 4 | 30:19 | 11 | 25 |
| 6 |
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VfL Halle 96 | 15 | 7 | 4 | 4 | 27:19 | 8 | 25 |
| 7 |
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SV SCHOTT Jena | 15 | 8 | 1 | 6 | 30:36 | -6 | 25 |
| 8 |
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Energie Cottbus II | 15 | 7 | 3 | 5 | 38:29 | 9 | 24 |
| 9 |
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SSV Markranstädt | 15 | 6 | 5 | 4 | 26:15 | 11 | 23 |
| 10 |
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VFC Plauen | 15 | 6 | 5 | 4 | 32:23 | 9 | 23 |
| 11 |
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Rot-Weiß Erfurt II | 15 | 6 | 4 | 5 | 30:22 | 8 | 22 |
| 12 |
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Union Sandersdorf | 15 | 5 | 5 | 5 | 22:24 | -2 | 20 |
| 13 |
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FC Einheit Rudolstadt | 15 | 5 | 4 | 6 | 20:19 | 1 | 19 |
| 14 |
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Askania Bernburg | 15 | 5 | 3 | 7 | 17:21 | -4 | 18 |
| 15 |
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BSG Wismut Gera | 15 | 5 | 2 | 8 | 18:26 | -8 | 17 |
| 16 |
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FC Eisenach | 15 | 2 | 1 | 12 | 8:47 | -39 | 7 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Rot-Weiß Erfurt II und Energie Cottbus II wurden zum Saisonende zurückgezogen. Dadurch verringerte sich die Zahl der sportlichen Absteiger. # Der FC Eisenach beantragte für die Saison 2016/2017 keine Oberligalizenz |
