# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Einheit Rudolstadt, Deutschland FC Einheit Rudolstadt 3 2 1 0 4:1 3 7
2 FC Carl Zeiss Jena II, Deutschland FC Carl Zeiss Jena II 3 2 0 1 9:3 6 6
3 VfL Halle 96, Deutschland VfL Halle 96 3 1 1 1 7:4 3 4
4 Bischofswerdaer FV, Deutschland Bischofswerdaer FV 2 1 1 0 4:2 2 4
5 1. FC Lok Leipzig, Deutschland 1. FC Lok Leipzig 2 1 1 0 3:2 1 4
6 SSV Markranstädt, Deutschland SSV Markranstädt 3 1 1 1 7:7 0 4
7 Union Sandersdorf, Deutschland Union Sandersdorf 3 1 1 1 3:4 -1 4
8 Inter Leipzig, Deutschland Inter Leipzig 3 1 0 2 5:7 -2 3
9 Energie Cottbus II, Deutschland Energie Cottbus II 3 1 0 2 4:7 -3 3
10 Askania Bernburg, Deutschland Askania Bernburg 2 0 2 0 5:5 0 2
11 BSG Wismut Gera, Deutschland BSG Wismut Gera 3 0 2 1 4:7 -3 2
12 Rot-Weiß Erfurt II, Deutschland Rot-Weiß Erfurt II 2 0 1 1 2:3 -1 1
13 FSV Barleben, Deutschland FSV Barleben 2 0 1 1 1:3 -2 1
  VFC Plauen, Deutschland VFC Plauen 2 0 1 1 1:3 -2 1
15 SV SCHOTT Jena, Deutschland SV SCHOTT Jena 2 0 0 2 1:5 -4 0
16 FC Eisenach, Deutschland FC Eisenach 2 0 0 2 3:10 -7 0
  Aufstieg
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt II und Energie Cottbus II wurden zum Saisonende zurückgezogen. Dadurch verringerte sich die Zahl der sportlichen Absteiger.

# Der FC Eisenach beantragte für die Saison 2016/2017 keine Oberligalizenz