| 10. Spieltag | 01.10.2016 | VfL Osnabrück | - | Jahn Regensburg | 1:2 | ||||
| 11. Spieltag | 15.10.2016 | Hansa Rostock | - | VfL Osnabrück | 1:2 | ||||
| 12. Spieltag | 22.10.2016 | VfL Osnabrück | - | SG Sonnenhof Großaspach | 1:0 | ||||
| 13. Spieltag | 29.10.2016 | Hallescher FC | - | VfL Osnabrück | 1:0 |  |
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| 22. Spieltag | 10.02.2017 | VfL Osnabrück | - | 1. FSV Mainz 05 II | 1:2 | ||||
| 32. Spieltag | 08.04.2017 | VfL Osnabrück | - | Hallescher FC | 1:2 | ||||
| 33. Spieltag | 16.04.2017 | FSV Frankfurt | - | VfL Osnabrück | 1:1 |  |
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| 34. Spieltag | 22.04.2017 | VfL Osnabrück | - | VfR Aalen | 1:0 | ||||
| 35. Spieltag | 29.04.2017 | Sportfreunde Lotte | - | VfL Osnabrück | 0:0 | ||||
| 36. Spieltag | 06.05.2017 | VfL Osnabrück | - | Fortuna Köln | 1:2 | ||||
| 37. Spieltag | 13.05.2017 | FSV Zwickau | - | VfL Osnabrück | 1:0 |
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