| 3. Spieltag | 10.08.2016 | Jahn Regensburg | - | Hallescher FC | 2:0 | ||||
| 15. Spieltag | 19.11.2016 | Jahn Regensburg | - | SV Wehen Wiesbaden | 3:1 |  |
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| 16. Spieltag | 26.11.2016 | Holstein Kiel | - | Jahn Regensburg | 2:1 | ||||
| 18. Spieltag | 10.12.2016 | Chemnitzer FC | - | Jahn Regensburg | 0:3 | ||||
| 20. Spieltag | 28.01.2017 | Hansa Rostock | - | Jahn Regensburg | 0:0 | ||||
| 21. Spieltag | 04.02.2017 | Jahn Regensburg | - | SG Sonnenhof Großaspach | 1:1 |  |
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| 22. Spieltag | 11.02.2017 | Hallescher FC | - | Jahn Regensburg | 1:1 | ||||
| 24. Spieltag | 25.02.2017 | VfR Aalen | - | Jahn Regensburg | 1:2 | |
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| 25. Spieltag | 04.03.2017 | Jahn Regensburg | - | Sportfreunde Lotte | 2:0 | ||||
| 26. Spieltag | 11.03.2017 | Fortuna Köln | - | Jahn Regensburg | 2:2 | ||||
| 27. Spieltag | 15.03.2017 | Jahn Regensburg | - | FSV Zwickau | 1:2 | ||||
| 28. Spieltag | 18.03.2017 | SC Paderborn 07 | - | Jahn Regensburg | 0:2 | ||||
| 29. Spieltag | 25.03.2017 | Jahn Regensburg | - | VfL Osnabrück | 1:2 | ||||
| 31. Spieltag | 04.04.2017 | Jahn Regensburg | - | 1. FSV Mainz 05 II | 2:1 | ||||
| 35. Spieltag | 29.04.2017 | Jahn Regensburg | - | Holstein Kiel | 0:3 | ||||
| 38. Spieltag | 20.05.2017 | Preußen Münster | - | Jahn Regensburg | 0:1 |
Deutschland