| 20. Spieltag | 01.02.2025 | 1. FC Köln II | - | Fortuna Düsseldorf II | 0:2 |  |
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| 21. Spieltag | 08.02.2025 | Fortuna Düsseldorf II | - | Bor. Mönchengladbach II | 0:1 | ||||
| 22. Spieltag | 15.02.2025 | Wuppertaler SV | - | Fortuna Düsseldorf II | 1:1 | ||||
| 23. Spieltag | 23.02.2025 | Fortuna Düsseldorf II | - | MSV Duisburg | 0:1 | ||||
| 24. Spieltag | 28.02.2025 | Sportfreunde Lotte | - | Fortuna Düsseldorf II | 3:3 | ||||
| 25. Spieltag | 08.03.2025 | Fortuna Düsseldorf II | - | FC Gütersloh | 0:2 | ||||
| 27. Spieltag | 29.03.2025 | Fortuna Düsseldorf II | - | Rot-Weiß Oberhausen | 0:0 | ||||
| 28. Spieltag | 05.04.2025 | Eintracht Hohkeppel | - | Fortuna Düsseldorf II | 0:0 |  |
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| 29. Spieltag | 13.04.2025 | Fortuna Düsseldorf II | - | SC Paderborn 07 II | 3:1 | ||||
| 30. Spieltag | 19.04.2025 | Fortuna Düsseldorf II | - | KFC Uerdingen 05 | annull. | ||||
| 31. Spieltag | 26.04.2025 | Fortuna Köln | - | Fortuna Düsseldorf II | 0:2 | ||||
| 32. Spieltag | 03.05.2025 | Fortuna Düsseldorf II | - | SC Wiedenbrück | 0:1 | ||||
| 33. Spieltag | 10.05.2025 | FC Schalke 04 II | - | Fortuna Düsseldorf II | 3:1 | ||||
| 34. Spieltag | 17.05.2025 | Fortuna Düsseldorf II | - | SV Rödinghausen | 4:1 |
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